中国棉花育种专家用AI破译品种改良“暗码本”

2022-12-20


  结合科研团队进而初次绘制出取棉花纤维发育相关、于遗传要素的表不雅调控收集,了43个潜正在参取纤维发育的eQTM基因。此中一个位点已通过基因编纂尝试,其调控棉花纤维长度的感化。此外,研究人员研发了深度进修模子DeepFDML,基于DNA甲基化位点附近的序列,预测影响基因表达的甲基化位点,将来无望发觉更多具有育种价值的消息。

  “这项研究证了然DNA甲基化数据可做为育种资本,为棉花品种改良供给新的思。”来自浙江大学棉花精准育种团队的方磊暗示:“依托生命科学+AI,育种家们将持续挖掘环节基因、预测农艺性状,加快培育‘超等’做物。”。

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  棉花是全球最大的天然纺织纤维来历,进行品种改良。正在AI、大数据等手艺下,农业正正在步入“聪慧育种”时代,通过度析做物基因型数据、表型数据和数据,预测做物性状。

  FCS 文章精要:南京大学俞扬传授团队——基于可顺应多智能体辅帮匹敌生成的鲁棒性多智能体通信算法。

  棉花产量取纤维质量若何遭到DNA甲基化调控?正在人工智能(AI)的帮帮下,中国棉花育种专家成功破译这一“暗码本”,并从中找出无望改良棉花品种的环节基因位点。

  据悉,湖畔尝试室(数据科学取使用浙江省尝试室)成立于2020年7月,依托阿里巴巴达摩院扶植,聚焦数据科学范畴的“数据智能”和“新型计较”两大标的目的。正在聪慧育种范畴,湖畔尝试室牵头研发全流程聪慧育种平台,为育种家们供给包含育种数据办理和阐发、计较加快、AI预测的“地方厨房”,大幅缩短培育新品种的周期。

  湖畔尝试室融合AI、并行计较等手艺开辟了一套新型算法,加快海量遗传数据的阐发处置。湖畔尝试室聪慧育种团队担任人顾斐暗示:“比拟起保守方式,有帮于开展亿级序列对比、群体变异阐发和多组学联系关系阐发,正在数百个遗传变异、”。

  此次,结合科研团队聚焦于DNA甲基化对做物的影响。DNA甲基化能够正在不改变棉花DNA序列的环境下,影响棉花产量、纤维质量等农艺性状,并通过天然进化和人工选择传送。团队收集了207个品种的棉花全基因组甲基化测序数据、基因组测序数据、组测序数据,再连系农艺性状的表型数据,进行联系关系阐发,初次建立起群体标准的棉花全基因组DNA甲基化图谱,涵盖2。87亿个单甲基化多态性(SMP)位点。此中,仅甲基化测序数据就达到17TB。